公元2019年，東京在經過一場浩劫后，全市即陷入空前的革命暴動，金田與鐵雄是從小到大的好朋友，而在一次飛車黨追逐拚斗之中，鐵雄因遇到一個具有超能力的小孩而發生車禍，等到金田一行人前去搭救時，卻親眼目睹鐵雄及超能力小孩都被軍方給帶走了。原來軍方一直在秘密利用人體做腦部實驗，想喚起那沈睡已久并足以毀滅世界的能量－阿基拉(AKIRA)，而鐵雄正好成為軍方人體實驗的對象。由于鐵雄的腦部已被改造，成了阿基拉重回地球的替身，阿基拉驚人的能量，即將帶給宇宙前所未有的一場大浩劫。